资源中心
数据展示中心
SeekOne
DD平台 转录组示例数据
数据集一：
样品来源： 健康人PBMC样品
实验方法：使用SeekOne
DD 单细胞3' 转录组建库试剂盒，按照说明书的要求在 SeekOneDigital Droplet System 数字液滴仪上完成单细胞分离、核酸标记、捕获等程序，所生成的高通量单细胞转录组文库使用Illunima NovaSeq 6000平台进行测序。
数据分析：使用Bcl2fastq将下机原始数据转换成fastq格式文件，并使用fastp质量过滤软件过滤掉低质量的测序数据。过滤后的测序结果使用SeekOne Tools工具进行单细胞数据分析，并生成单细胞文库质控结果、表达矩阵以及比对结果等中间文件。
数据下载：
数据集二：
样品来源：小鼠脑组织细胞核
实验方法：使用SeekOneDD 单细胞3' 转录组建库试剂盒，按照说明书的要求在 SeekOneDigital Droplet System 数字液滴仪上完成单细胞核的分离、核酸标记、捕获等程序，所生成的高通量单细胞转录组文库使用Illunima NovaSeq 6000平台进行测序。
数据分析： 使用Bcl2fastq将下机原始数据转换成fastq格式文件，并使用fastp质量过滤软件过滤掉低质量的测序数据。过滤后的测序结果使用SeekOneTools 工具进行单细胞数据分析，并生成单细胞文库质控结果、表达矩阵以及比对结果等中间文件。 SeekOneTools支持将比对到内含子区域的reads 计入 UMI计数，从而更好的支持提核类型的样品。
数据下载：
（原始数据较大，下载可能需要较长时间）
（原始数据较大，下载可能需要较长时间）
数据集三：
样品来源： 健康人PBMC样品
实验方法：使用SeekOneDD 单细胞全序列 转录组建库试剂盒，按照说明书的要求在 SeekOneDigital Droplet System 数字液滴仪上完成单细胞分离、核酸标记、捕获等程序，所生成的高通量单细胞转录组文库使用Illunima NovaSeq 6000平台进行测序。
数据分析：使用Bcl2fastq将下机原始数据转换成fastq格式文件，并使用fastp质量过滤软件过滤掉低质量的测序数据。过滤后的测序结果使用SeekSoulTools工具进行单细胞数据分析，并生成单细胞文库质控结果、表达矩阵以及比对结果等中间文件。
数据下载：
（原始数据较大，下载可能需要较长时间）
分析软件
（原始数据较大，下载可能需要较长时间）
数据集四：
样品来源： 细胞系A549：KRAS G12S；HCC827 EGFR 19del和K562: BCR-ABL1 fusion按照1:1:1混合
实验方法：使用SeekOneDD 单细胞全序列 转录组建库试剂盒，按照说明书的要求在 SeekOneDigital Droplet System 数字液滴仪上完成单细胞分离、核酸标记、捕获等程序，所生成的高通量单细胞转录组文库使用Illunima NovaSeq 6000平台进行测序。
数据分析：使用Bcl2fastq将下机原始数据转换成fastq格式文件，并使用fastp质量过滤软件过滤掉低质量的测序数据。过滤后的测序结果使用SeekSoulTools工具进行单细胞数据分析，并生成单细胞文库质控结果、表达矩阵以及比对结果等中间文件。
数据下载：
