服务与解决方案
寻因生物提供建库测序服务,该服务是利用寻因生物自主研发的SeekOneMM (Microwell & MagneticBeads) 大孔径高通量单细胞转录组试剂盒或者SeekOne DD (Digital Droplet) 单细胞3' 转录组试剂盒构建测序文库,直接对接Illumina或华大高通量测序仪进行测序的服务。
服务流程
SeekOne单细胞转录组构建的测序文库适用的测序平台有哪些?
常见问题
单细胞建库测序服务
该文库目前适用于Illumina高通量测序平台,如使用华大智造的MGISQ测序平台,需在测序前对文库进行环化。
1. 单细胞捕获与标记流程
SeekOneMM单细胞的分离是通过SeekOneChip实现的。将质检合格的单细胞悬液注入到微孔芯片中,通过加入Barcoded Beads、细胞裂解酶将细胞裂解后捕获mRNA。其技术核心是Barcoded Beads以及SeekOneChip。
SeekOneDD单细胞的分离是通过SeekOneDD系统实现的。将质检合格的单细悬液注入到配套芯片中,通过Barcoded Beads、细胞裂解液将细胞裂解后捕获mRNA。其技术核心是微流控数字液滴和Barcoded Beads。
文库构建
单细胞分离标记
高通量测序
2、逆转录及文库构建
使用Oligo(dT) primer 对带有polyA尾的RNA(主要mRNA)进行逆转录,并进行文库扩增。 通过末端修复、加A、以及P5和P7测序接头,构建测序文库。
3、测序
测序平台
Illumina/华大
测序策略
PE150
建议测序量
≥50,000 reads/cell,以确保单细胞测序数据分析的准确性。每
个样本推荐测序100G(建议捕获5,000-6,000个细胞)