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SeekOne平台简介

SeekOne是寻因生物自主研发拥有知识产权的高通量单细胞建库平台,包含单细胞标记两大主流技术:油包水法SeekOneDD和微孔芯片法SeekOneMM。
SeekOne
DD 可在3分钟生成15万微液滴,避免RNA的降解,高效完成单细胞的分离标记,搭配寻因生物相对应的试剂盒可以完成不同的科研需求;SeekOneMM系统最大的优势是无需配备大型仪器,高度便携化的设计可满足更多实验需求。
寻因生物致力于单细胞技术普适化,利用高分辨率的单细胞技术,携手科研及临床专家,推动肿瘤、免疫、细胞发育、感染、用药指导及靶向筛选等领域的基础研究和相关的医学转化应用落地。

SeekOneDD系统产品简介

SeekOneDD系统基于微流控技术原理,通过油包水实现单细胞分离捕获,利用凝胶微珠上Barcoded Beads对不同细胞进行标记,通过UMI的标签对mRNA进行定量,来构建高通量单细胞文库,数据下机后使用SeekOne Tools完成单细胞数据质控处理。基于SeekOne DD系统研发了SeekOneDD单细胞 3' 转录组与SeekOne DD单细胞 5' 转录组+免疫组库两款试剂盒。

SeekOne数字液滴仪


SeekOne数字液滴仪—采用先进的微流控技术,3min快速生成15万个油包水液滴。

SeekOne DD—产品性能
技术原理:油包水 直径要求:5-40μm
细胞通量(单通道):500-12,000 双胞率:0.3/1,000
样本通量:1-8 细胞捕获率:高达65%
通量灵活性:单张芯片对应单个样本,无多余芯片浪费 效率:3min快速生成15万个油包水液滴

 

SeekOneDD系统产品技术原理

3min生成15万个油包水液滴

单细胞捕获率高达65%

单通道可捕获500-12,000个细胞

1,000个细胞双胞率低至0.3%

Cell Barcode:标记不同的细胞;约 90万种

UMI:标记同一细胞来源的不同mRNA

SeekOneDD系统结果展示

Sample Estimated Number of Cells Mean Reads per Cell Median Genes per Cell Number of Reads Valid Barcodes Reads Mapped Confidently to Genome Total Genes Detected Median UMI Counts per Cell
人某肿瘤组织 6,007 12,469 1,575 114,075,739 92.60% 71.60% 16,239 5,735
小鼠某正常组织 5,181 30,843 1,861 159,798,567 93.95% 77.14% 22,504 3,829

 

SeekOneDD单细胞 3' 转录组试剂盒


SeekOneDD单细胞 3' 转录组试剂盒。

SeekOneTools

自动完成细胞标签的提取、数据质控、基因定量以及聚类分析等,并生成可视化的分析报告。

SeekOneDD单细胞 5' 转录组+免疫组库试剂盒


SeekOneDD单细胞 5' 转录组+免疫组库试剂盒

SeekOneMM系统产品简介

SeekOneMM便携化的高通量单细胞微孔平台。通过寻因自主研发微孔芯片SeekOneChip实现单细胞捕获,并利用核酸修饰的Beads对不同细胞来源的RNA进行分子标记,最终构建兼容Illumina及华大智造T7测序仪的高通量单细胞转录组文库,数据下机后使用SeekOneTools完成单细胞数据质控处理。

SeekOneMM系统捕获流程

微孔中加入细胞

微孔中加入Barcoded Beads

细胞裂解

mRNA与Barcoded Beads结合

收集Beads进行逆转录

SeekOneChip / SeekOneChip B

SeekOneMM单细胞转录组建库试剂盒性能参数

芯片 SeekOne Chip 常规版 SeekOne Chip 高密度版 SeekOne Chip B 大孔径版
微孔数 17W 30W 3.2W
微孔直径 39μm 39μm 130μm
适用细胞直径 细胞5-30μm 细胞5-30μm

球形细胞 10-70μm

长条形细胞<100μm

捕获细胞数 500-10,000 1,000-30,000 500-3,000
产品优势    灵活:
   样本通量灵活(单人操作可同时处理1~4个样本)无需配备昂贵仪器。
   高效:
   2h即可完成单细胞捕获与逆转录。
   精准:
   双细胞率低于0.7%,双标系统同时标记细胞及mRNA分子。
   经济:
   优化的核酸标签技术保证更少的平衡文库依赖。
   还原细胞本质:
   兼容至100um细胞,无需提核,全面获得细胞内转录组信息。
   精准数据产出:
   去除多余杂志降低背景噪音,保证数据精准。
   细胞类型兼容:
   全方位捕获大小不一细胞,还原组织原始比例。
   实验条件灵活:

   无需设备,操作灵活便捷
。

 

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SeekOne

高通量单细胞建库双技术平台

 

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