单细胞分辨下鼻咽癌的肿瘤异质性和细胞间网络

 

 

发表时间:2021.02.02
发表期刊:Nature Communications
影响因子:12.121
研究背景:肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的高密度与鼻咽癌(NPC)患者良好的生存预后相关。NPC的肿瘤微环境中不同细胞群的组成尚不清楚。前期研究利用单细胞分析证明了NPC肿瘤中存在具有不同功能状态的T细胞和不同的免疫细胞。
研究目的:研究鼻咽癌(NPC)的肿瘤微环境(TME)的异质性。
样本选择:10例未接受治疗的EBV+NPC患者及其配对的PBMC
研究方法及结果:本研究使用单细胞转录组和TCR测序,分析了10个NPC患者的肿瘤-血液,得到176447个细胞。分析揭示了53种细胞亚型,包括CD8+ T细胞、Treg、树突状细胞(DCs),以及不同EBV病毒感染状态的恶性细胞。轨迹分析显示,肿瘤中耗竭CD8+ T细胞和免疫抑制TNFRSF4+ Treg细胞可能分别来自外周CX3CR1+CD8+ T细胞和初始Treg细胞。此外,本研究还发现了免疫调节和耐受的LAMP3+ DCs。值得注意的是,本研究观察到LAMP3+DCs、Treg、耗竭CD8+ T和恶性细胞之间强烈的相互作用,表明可能存在交叉效应促进TME的免疫抑制。
技术路线:

 

 

研究结论:本研究揭示了在单细胞分辨率下,NPC中TME的异质性和相互作用,这为NPC的进展机制和NPC精准治疗提供了见解。

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