人类胸腺发育细胞图谱定义了TCR的形成

 

 

发表时间:2020.02.21
发表期刊:Science 
影响因子:47.724
研究背景:胸腺是T细胞发育和T细胞受体(TCR)库形成的关键器官,对适应性免疫的形成至关重要。T细胞的发育与胸腺微环境中各种细胞类型的相互协调密不可分。虽然科学家已经使用多种动物模型对胸腺进行了广泛的研究,但如果没有详细的人类胸腺图谱,就无法理解人类免疫力的真实情况。
研究目的:绘制人类生命过程中的胸腺细胞图谱。
样本选择:胚胎发育、童年和成年期间的人类胸腺样本。
研究方法及结果:研究者共获得超过25万个单细胞样本,从发育中的胸腺获得138,397个细胞,从出生后的胸腺中获得117,504个细胞。通过进行scRNA-seq,研究团队在人胸腺中鉴定出50多种不同的细胞状态。通过scTCR-seq,比较不同细胞的TCR库,分析不同类型的细胞之间是否存在TCR库的差异。同时,研究者还计算预测了人类T细胞发育的轨迹,包括从胎儿肝脏的早期造血祖细胞分化为多种成熟的T细胞类型,并利用该轨迹构建了驱动T细胞发育分化的假定转录因子机制。
技术路线:

 

 

研究结论:提供了人类整个生命周期胸腺综合图谱,并对人类T细胞发育提供了新的见解。

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