肺肿瘤微环境中基质细胞的表型塑造

 

• 发表时间：2018年
• 发表期刊：Nature Medicine
• 影响因子：32.621
• 研究背景：肿瘤微环境（TME）是一个复杂的基质细胞生态系统。肿瘤周围的组织、免疫细胞、血管和细胞外基质共同形成了TME，对肿瘤的生长和侵袭至关重要。
• 研究目的：绘制肺肿瘤细胞图谱。
• 样本选择：肺癌样本（5个患者19个样本，涉及不同亚型、组织类型，共得到52,698个单细胞）
• 研究方法及结果：本文通过10x genomics单细胞转录组测序探索基质细胞的亚群分类、基因功能（信号通路）、关键marker基因和临床预后。共鉴定出52个基质细胞亚群，反映了肿瘤微环境复杂性，包括迄今为止被认为是同质的细胞亚型中的新亚群，以及其异质性的转录因子。
• 技术路线：

 

•研究结论：在肺癌TME中发现了可以指导表达不同胶原蛋白的成纤维细胞、下调免疫细胞归巢的内皮细胞和与已建立的免疫检查点转录本以及与T细胞活性相关的基因。通过对来自1572例患者的Bulk RNA测序数据中这些细胞亚型的标记基因进行评估，阐明了这些标记基因如何与生存相关，并通过免疫组化验证了TME中存在独立的细胞实体，而免疫荧光证实肺癌TME中存在四种内皮细胞和成纤维细胞亚型，同时还有一些免疫亚型的单细胞。研究人员还指出这些细胞亚型与患者存活率存在关联。他们发现基质细胞数量可以反映癌细胞的侵袭性，肿瘤的侵袭性越强，就含有越多的基质细胞。因此，这些基质细胞亚型及其特异性标记基因有机会作为肺癌的预后以及治疗反应预测的生物标记。