送样要求

SeekOneMM

单细胞转录组全套解决方案

服务流程

组织样本解离

单细胞分离标记

文库构建

数据分析

高通量测序

样本通量灵活(单人操作可同时处理1~4个样本) 

无需配备昂贵仪器

灵活

组织

≥200 mg

（黄豆粒大小）

新鲜组织样本

穿刺样本

≥3条

新鲜穿刺样本

湿冰

4~6 mL

无严重溶血

新鲜血液

冻存PBMC

细胞量不低于

100万个

冻存前需完成红细胞裂解

保证细胞活率＞90%

冻存时使用冻存盒梯度降温冻存

-80℃，

干冰运输

2-8℃

2-8℃

置于组织保存液

单细胞悬液

生信分析

测序数据过滤

与质量评估

单细胞数据质控分析

 

UMI统计

基因组比对

基因检测数统计

有效细胞数统计

基因表达定量

定制化分析

定制化部分结果展示

样本数量

应用案例

案例一：肺肿瘤微环境中基质细胞的表型塑造

常见问题

SeekOne单细胞转录组构建的测序文库适用的测序平台有哪些？

该文库目前适用于Illumina高通量测序平台，如使用华大智造的MGISQ测序平台，则需在测序前对文库进行环化。

SeekOneMM(Microwell&MagneticBeads)单细胞转录组测序是采用寻因生物自主研发的SeekOneMM单细胞转录组试剂盒进行单细胞转录组建库，该试剂盒无需配套昂贵仪器，通过微孔芯片(SeekOneChip)和核酸标记磁珠(Barcoded Beads)即可实现单细胞的捕获、标记。最终构建出兼容Illumina 测序仪的高通量单细胞转录组文库进行测序，随后进行一系列生信分析。

服务优势

精准

双细胞率低于0.7%

双标系统同时标记细胞及mRNA分子

数据分析软件准确度高

高效

单细胞捕获效率高达60%

2小时即可完成单细胞捕获与逆转录

解离经验丰富

数十种物种、百余种组织类型的解离实战经验

样本类型

样本量

接收标准

运输条件

备注

浓度：

400-1000 cells/μL

体积：>100 μL

细胞活性：＞90%

结团率：＜5%

有核率：＞70%

细胞直径范围: 5~30 μm

4℃

建议液体体积充满1.5ml保存管，避免运输途中震荡起泡

体液

体液内活细胞

数量≥10万个

新鲜体液

湿冰

此处体液类样品包括但不限于：尿液、胸水、腹水、灌洗液、脑积液等

细胞图谱构建

 

数据降维PCA分析

细胞聚类UMAP/tSNE分析 

Cell type注释

差异表达分析

 

marker基因Violin图分析

marker基因t-SNE图分析

marker基因heatmap图分析

组织/样本cell type差异分析

功能注释与分析

 

GO/KEGG功能富集分析

Reactome功能富集分析

蛋白互作网络分析

marker基因TF注释

细胞分群

进化

细胞通讯

突变

功能

联合分析

细胞再聚类

细胞亚群手动注释

拟时序分析

Monocla/Scanpy

/Pseudotime选一

RNA速率分析

配体受体分析

inferCNV分析

SNP分析

GSEA/GSVA富集分析

WGCNA分析

选择数据差异富集分析

scDOSE基因和

疾病富集注释（人）

SCENIC分析

TCGA联合分析

Bulk RNA联合分析

细胞通讯分析

拟时序分析

GSVA基因富集变异分析

案例二：单细胞水平描绘系统性红斑狼疮的异质性

案例三：绘制人类垂体发育的转录景观图谱